Trung Hoa Dân Quốc thiết lập quan hệ ngoại giao với chính phủ miền Nam Việt Nam (Việt Nam Cộng Hòa) trước đây, đặt Đại sứ quán tại Sài Gòn và Tổng Lãnh sự quán tại Đà Nẵng. Ngày 30 tháng 4 năm 1975, chính quyền miền Nam Việt Nam đổi thay, chính phủ miền Bắc Việt Nam tiếp quản, sáp nhập hai miền nam bắc, với tên gọi là nước Cộng Hòa Xã Hội Chủ Nghĩa Việt Nam, ta đóng cửa Đại sứ quán Sài Gòn.
Ngày 30 tháng 6 năm 1992, Đài Loan và Việt Nam ký kết thỏa thuận thiết lập Văn phòng đại diện hai bên. Tháng 11 năm 1992, Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Đài Bắc tại Việt Nam được thành lập tại Hà Nội (gọi tắt là Văn phòng đại diện tại Việt Nam) và Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Đài Bắc tại Thành phố Hồ Chí Minh (gọi tắt là Văn phòng tại Thành phố Hồ Chí Minh). Phía Việt Nam thành lập Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Việt Nam tại Đài Bắc vào tháng 5 năm 1993 tại Đài Bắc.
Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Đài Bắc tại Thành phố Hồ Chí Minh quản lý các công việc trong địa phận của miền Nam Việt Nam từ Đà Nẵng trở vào đến đảo Phú Quốc, gồm 29 tỉnh và 3 thành phố trực thuộc. Nhiệm vụ chính là công tác liên hệ nhằm thắt chặt mối quan hệ với chính quyền các cấp trong khu vực đóng trú, đẩy mạnh sự giao lưu và hợp tác giữa ta với nơi đóng trú trên các lãnh vực kinh tế thương mại, văn hóa, khoa học kỹ thuật, nông nghiệp, lãnh sự, công tác kiều vụ v.v…, nhằm nâng cao quan hệ thực chất toàn diện giữa hai bên.
Trong khu vực địa phận quản lý của Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Đài Bắc tại Thành phố Hồ Chí Minh, doanh nghiệp Đài Loan đầu tư vào Việt Nam tập trung chủ yếu tại các tỉnh, thành như Thành phố Hồ Chí Minh, tỉnh Bình Dương, tỉnh Đồng Nai, tỉnh Long An, tỉnh Tây Ninh, tỉnh Lâm Đồng và tỉnh Bà Rịa Vũng Tàu; Phụ nữ Việt Nam lấy chồng Đài Loan đa số là dân của vùng này như thành phố Cần Thơ, tỉnh Tây Ninh, tỉnh Tiền Giang, tỉnh Vĩnh Long, tỉnh Sóc Trăng, tỉnh Bến Tre.
Kể từ khi thành lập vào tháng 11 năm 1992 đến nay, Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Đài Bắc tại Thành phố Hồ Chí Minh luôn giữ mối quan hệ tốt đẹp với Ủy ban Nhân dân và các sở, ban ngành của các tỉnh, thành trong khu vực, chủ nhiệm và các viên chức trong Văn phòng thường xuyên tổ chức chuyến thăm và xây dựng tình cảm sâu sắc bền vững với cán bộ viên chức cơ quan hữu quan tại các tỉnh, thành. Văn phòng Kinh tế và Văn hóa Đài Bắc tại Thành phố Hồ Chí Minh trong những năm vừa qua đều được Ủy ban Nhân dân mời tham dự các hoạt động, và các tỉnh, thành khi tổ chức hội nghị giới thiệu môi trường đầu tư đều có lời mời đến Văn phòng và doanh nghiệp Đài Loan đến tham dự.
